拜仁慕尼黑篮球部（德语：Basketballabteilung des FC Bayern München）是来自德国巴伐利亚州首府慕尼黑的一个体育俱乐部，成立于1946年。在组建的前十年，男队能够赢得多项国家性质的成就，其中包括1954年、1955年的德国冠军和1968年的德国篮协杯冠军。然而，男队此后便长期混迹于低级别联赛。自2011-12赛季起，他们得以重返篮球联邦联赛（BBL）作赛。在距上一次夺冠59年后，男队才于2014年夺得队史第三个德国冠军。此外，篮球部还设有对应不同年龄段的多支青少年梯队，包括参加青年篮球联邦联赛（NBBL）的U-19梯队和参加少年篮球联邦联赛（JBBL）的U-16梯队。
至2014年10月1日，篮球部被剥离出来并成立“拜仁慕尼黑篮球有限公司”，拜仁慕尼黑足球俱乐部是其唯一股东。该公司由总经理马尔科·佩希奇及福尔克·斯蒂克斯负责打理。
成立于1946年的拜仁慕尼黑篮球部尤其能在1950年代和1960年代的男子领域取得重大成就，并将本地的竞争对手、二战后的首个冠军得主MTSV施瓦宾远远的抛在了身后。这些成就包括赢得1954年和1955年的德国篮球冠军，以及十年后于1968年的德国篮协杯冠军。然而，球队逐渐被同城对手USC慕尼黑赶上并超越，后者曾参加顶级联赛至1977年以及参加次级联赛至1988年。拜仁篮球队终于在1974年从篮球联邦联赛（BBL）降级。
在双轨制的第二篮球联邦联赛于1975年成立后，拜仁最初还未曾从南区脱颖而出。直至拜仁历史上的首个篮球明星克劳斯·舒尔茨（Klaus Schulz）在接受俱乐部主席威利·O·霍夫曼之托，出任当时深陷第三级别联赛的篮球部门主管后，才将球队带回顶级联赛。
1982年，球队升入次级联赛，并在五年后重返国家最高级别的BBL。拜仁俱乐部主席弗里茨·舍雷尔和总经理乌利·赫内斯停止了对篮球项目的注资，使得球队在财政和竞技条件都不再具有竞争力。在第二个赛季，即1989年，球队便于再次降入次级联赛。至1993年，他们又离开次级联赛，进一步跌落至地区联赛。在1995-96赛季，拜仁又重返次级联赛，但仅维持了一年，而在1999-00赛季和2004-05赛季又重复了这样的循环。然而，作为球队最稳定参加的级别（已度过11个赛季），第二篮球联邦联赛于2007年被新成立的ProA和ProB两档联赛所取代。自2005年降级后，球队在东南地区联赛以仅输一场的成绩占据积分榜首，却由于缺乏母俱乐部的支持而未能实现升级。
男子U-19梯队自2006-07赛季起已能够再次参加代表国家最高级别、新成立的青年篮球联邦联赛（NBBL），并在随后一个赛季能够进入争夺青年冠军的季后赛。而成年队在2007-08赛季则再度锁定地区联赛的头把交椅，得以从这个自ProB设立后已沦为第四级联赛的赛事中脱颖而出。同时由于承接了杜塞尔多夫魔术的参赛牌照，球队得以在2008-09赛季于第二级别的ProA开始作赛，从而跃升了一个级别。在2010年春季的一项俱乐部内部调查报告中显示，约75%的参与会员都赞成资助篮球部变强，并且一线队应当重返BBL。为了实现这些目标，球队于2010-11赛季签入了迪尔克·鲍尔曼，由这位联邦主教练兼任俱乐部职业队的主教练。随着队伍全面更新，尤其是引入了国手斯特芬·哈曼和德蒙·格雷内进行补强，他们在2011年3月便已提前七轮锁定升入篮球联邦联赛（BBL）。
在自1989年以来参加的首个联邦联赛中，拜仁慕尼黑以积分榜第五名完赛，并获得季后赛资格，但在四分之一决赛遭阿特兰飞龙淘汰。由于获得了由欧洲篮球联赛联盟（ULEB）发放的外卡，拜仁球员还参加了2011-12赛季的篮球欧洲杯。新赛季开启后不久，俱乐部便与主教练鲍尔曼分道扬镳，他的继任者最初是前助理教练扬尼斯·克里斯托普洛斯，直至斯韦蒂斯拉夫·佩希奇于11月27日上任。在佩希奇治下，球队成为了2013年的联赛杯四强，却仍在半决赛被其后的冠军欧绿保柏林所击败。在2012-13赛季的BBL常规赛中，拜仁排名第四，使得他们在季后赛四分之一决赛再度遭遇欧绿保柏林。这一次，佩希奇的球队能够以3比0的总比分横扫首都球队。至半决赛，拜仁慕尼黑与卫冕冠军班贝格博泽进行激烈对决，最终以总比分2比3惜败。
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